Wojciech Wilkowski urodził się 30 stycznia 1939 r. w Umieninie-Żelazkach (obecny powiat płocki). W 1961 r. ukończył studia na Wydziale Geodezji i Kartografii Politechniki Warszawskiej, uzyskując stopień magistra inżyniera geodety (specjalność fotogrametria i topografia). W tym samym roku zatrudnił się w Pracowni Geodezyjnej Wojewódzkiego Zarządu Dróg Publicznych w Warszawie (początkowo jako stażysta, a następnie na stanowisku inżyniera geodety), a w 1965 r. – w Biurze Urządzania Lasu i Projektów Leśnictwa (na stanowisku kierownika pracowni geodezyjnej). W 1969 r. został dyrektorem Oddziału Regulacji Stanu Posiadania BULiPL.
W latach 1971–1985 był głównym geodetą Ministerstwa Leśnictwa i Przemysłu Drzewnego (do czasu likwidacji tego resortu), a w latach 1986–1989 – głównym geodetą Biura Urządzania Lasu i Geodezji Leśnej.

W 1973 r. został skierowany na zaoczne studia doktoranckie prowadzone przez WGiK PW. Po ich ukończeniu i obronie rozprawy doktorskiej w 1978 r. zaczął łączyć dotychczasową działalność zawodową z pracą naukowo-dydaktyczną w Instytucie Geodezji Gospodarczej WGiK PW.
W 1987 r. uzyskał stopień doktora habilitowanego i został zatrudniony na stanowisku docenta (1989), a po uzyskaniu tytułu profesora nauk technicznych (1996) – na stanowisku profesora nadzwyczajnego. W latach 2002–2012 był profesorem zwyczajnym PW. Pełnił funkcję dyrektora Instytutu Geodezji Gospodarczej (1991–2008), a w latach 1991–2013 kierował Zakładem Geodezji Rolnej i Leśnej WGiK (po zmianie nazwy – Zakładem Katastru i Gospodarki Nieruchomościami).
Przez wiele lat był też związany z Wydziałem Inżynierii Lądowej i Geodezji Wojskowej Akademii Technicznej w Warszawie, gdzie był zatrudniony na stanowisku profesora zwyczajnego WAT.

W 1992 r. uruchomił na Politechnice Warszawskiej studia podyplomowe „Wycena nieruchomości”, a w 2005 r. kolejne – „Zarządzanie nieruchomościami”. W 1998 r. we współpracy z Sheffield Hallam University oraz The Royal Institution of Chartered Surveyors (której od 1990 r. był członkiem honorowym) stworzył studia podyplomowe z wyceny nieruchomości i zarządzania (Postgraduate Diploma Property Valuation & Management) prowadzone w języku angielskim.

Był członkiem licznych organizacji naukowych, m.in. Komitetu Geodezji Polskiej Akademii Nauk, Rady Naukowej Centrum Informatycznego Geodezji i Kartografii, Rady Naukowej Instytutu Geodezji i Kartografii, Towarzystwa Rozwoju Obszarów Wiejskich. W ramach Międzynarodowej Federacji Geodetów (FIG) działał w dwóch Komisjach: Professional Standards and Practice oraz Cadastre and Land Management.
W latach 1996–2006 pełnił funkcję doradcy trzech kolejnych głównych geodetów kraju. Jako przedstawiciel GUGiK czynnie uczestniczył w posiedzeniach Agendy ONZ w Genewie (Committee on Human Settlements – Working Party on Land Administration United Nations). Przez wiele lat był członkiem Państwowej Rady Geodezyjnej i Kartograficznej. Ponadto przewodniczył pracom wielu zespołów eksperckich i ciał doradczych lub był ich członkiem.
W 1982 r. wszedł w skład kolegium redakcyjnego miesięcznika naukowo-technicznego „Przegląd Geodezyjny”, którego w latach 1987–2015 był redaktorem naczelnym.
Był autorem 11 monografii, autorem i współautorem 250 artykułów, promotorem licznych prac doktorskich, recenzentem rozpraw doktorskich i habilitacyjnych oraz wniosków o nadanie tytułu profesora nauk technicznych. Został odznaczony m.in. Medalem Komisji Edukacji Narodowej, Srebrnym i Złotym Krzyżem Zasługi.

Problematyka badawcza, którą zajmował się prof. Wilkowski, dotyczyła geodezji leśnej, katastru oraz gospodarki nieruchomościami na obszarach wiejskich. W kręgu jego zainteresowań znajdowały się również zagadnienia stosowania metod geodezyjnych w ochronie środowiska. W latach 90. ubiegłego wieku podjął prace związane z rynkowym podejściem do gospodarki nieruchomościami oraz metodyką określania wartości nieruchomości rolnych i leśnych, a także ze strukturą przestrzenną gospodarstw rolnych realizowaną głównie w pracach scaleniowo-wymiennych. Pod koniec lat 90. i na początku nowego wieku prowadzone przez profesora badania zaczęły koncentrować się na funkcjonowaniu zintegrowanych systemów katastralnych na świecie oraz możliwości ich adaptacji do warunków polskich.

Wywiad z prof. Wojciechem Wilkowskim oraz jego obszerny życiorys można znaleźć w jubileuszowej publikacji pt. „Poczet Profesorów”.

Zmarł 3 lutego 2025 r. w wieku 86 lat.

Autor zdjęcia: Stanisław Nazalewicz