Profesor Wójcik prowadzi kluczowe projekty naukowe i badawcze poświęcone przede wszystkim zagrożeniom osuwiskowym. Wspiera rozwój nauk o Ziemi również poza granicami kraju. Jako pełnomocnik PIG ds. współpracy z Mongolią w zakresie badań geologicznych i poszukiwawczo-złożowych organizuje i koordynuje wspólne przedsięwzięcia z tamtejszymi geologami. Uczestniczył również w wielu międzynarodowych ekspedycjach. Jest między innymi odkrywcą prekambryjskich tillitów w rejonie Gór Khasagt.
Oprócz działalności naukowej prowadzi też ścisłą współpracę z administracją samorządową i rządową. Wykonał kilkaset opinii projektów robót geologicznych, dokumentacji geologiczno-inżynierskich oraz projektów zabezpieczenia osuwisk m.in. dla samorządów województw małopolskiego, podkarpackiego i śląskiego. Od prawie dwóch dekad działa w Wojewódzkim Zespole Nadzorującym Realizację Zadań w Zakresie Przeciwdziałania Ruchom Osuwiskowym oraz Usuwania ich Skutków przy Wojewodzie Małopolskim.
Profesor Antoni Wójcik jest szanowanym recenzentem, autorem i współautorem kilkuset publikacji oraz blisko 30 arkuszy Szczegółowej Mapy Geologicznej Polski (SMGP) i 5 map przeglądowych.
W trakcie długoletniej pracy przekazywał swoim uczniom i współpracownikom wiedzę, wspierając ich doświadczeniem oraz zachęcając do upartego poszukiwania odpowiedzi na trudne pytania. Jest wychowawcą kilku pokoleń geologów i promotorem dwunastu prac doktorskich (w trakcie przygotowania są trzy kolejne dysertacje doktorskie).
Za swoją działalność naukową, edukacyjną i organizacyjną był wielokrotnie nagradzany, między innymi Krzyżem Kawalerskim Orderu Odrodzenia Polski (2022 r.), Złotym Krzyżem zasługi (2014 r.), odznakami: „Zasłużony dla Polskiej Geologii (1989 r.), „Zasłużony dla Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej (1995 r.), „Za zasługi dla Geodezji i Kartografii” (2014 r.) oraz Złotą Odznaką PIG (2000 r.).
Osiągnięcia naukowe, organizacyjne i społeczne prof. Antoniego Wójcika są podziwiane i wysoko cenione przez całą społeczność geologów. Przez pięć dekad przyjmował zasadę, że życie wypełnione ciężką i rzetelną pracą daje poczucie satysfakcji oraz motywację do dalszego realizowania swoich marzeń.